Стотт родился в Лондоне в 1921 году. В 1938 году Стотт услышал проповедь с призывом к покаянию и стал последователем Христа.

Стотт был рукоположен в 1945 году и стал священником в «Церкви всех святых», эта была церковь, в которой он вырос и провел почти всю жизнь, за исключением нескольких лет, проведенных в Кембридже. Он написал более 50 книг, некоторые из которых появляются только на китайском, корейском и испанском языках, а также много статей и докладов.

В 2005 году выбран в журнале «Тайм» как один из самых влиятельных людей в мире. Стотт оставался безбрачным всю жизнь. Увлекался наблюдением за птицами